miércoles, abril 29, 2009

Otro trabajo extra

Hola como ya les había dicho les pongo otro trabajo para entregar el 6 de mayo, día que en principio las cosas podrían regresar a la normalidad aunque hay que estar pendientes.

Este trabajo es exclusivo para realizarse en internet, ya que es de bioinformática. Lo que podrán obtener con este trabajo dependerá de su esfuerzo y lo discutiremos cuando regresemos a clases.

Conforme vayan avanzando yo les diré lo siguiente a realizar, así que será por medio de su trabajo constante que obtendrán su calificación, yo trataré de ver mi correo 2 veces al día para resolver sus dudas.

Esta es una secuencia de DNA que contiene un gen.

El primer objetivo es que encuentren el gen, en clase ya dimos cuales son las características que se buscan en la secuencia.

Para hacer esto de una manera sencilla utilicen la siguiente página:

http://oz.ifc.unam.mx:16080/EMBOSS/

Aquí entontrarán una serie de herramientas que les podrán ayudar.

Para realizar la primera busquen en el menú de la izquierda:

NUCLEIC TRANSLATION

con alguna de las aplicaciones podrán deducir de donde a donde esta el gen. Una ayuda es que esta en el sentido de la secuencia que les doy, es decir no requieren a la cadena complementaria.

No se requiere de mucho esfuerzo, sólo de que se pongan a jugar con la secuencia.

Cuidense y espero sus correos para darles la siguiente indicación.

Paco

jueves, abril 23, 2009

Presentaciones de las clases

Les dejo las presentaciones de las últimas clases en PDF:

Traducción

Reparación de DNA

Regulación Génica

Artículo para trabajo del lunes

Les dejo el artículo que es para el trabajo del lunes.

Las preguntas son las siguientes:

¿Que es el Bortezomib?

¿A que se refieren con Neddylation?

¿Que es MLN4924?

¿Porque piensan que se puede utilizar como un farmaco para tratar cancer?

Tienen que entrgarme en una hoja las respuestas de estas preguntas junto con un comentario donde expliquen la idea central de la nota.

martes, abril 21, 2009

Clase de miercoles 22 de abril

Hola el día miercoles 22 de abril, terminaremos de revisar modificaciones post-traduccionales y degradación de proteínas. Son temas cortos así que comenzaremos también con Mutaciones y reparación del DNA, les pido por favor que estudien para la clase.

Gracias

miércoles, abril 15, 2009

Presentaciones de las clases

Algunos de ustedes me han pedido las presentaciones de las clases y aqui se las dejo en formato PDF.

Estructura del DNA

Dominios de union a DNA

Duplicación del DNA

Transcripción

martes, abril 07, 2009

Trabajo para dos puntos extras

Hola este es un trabajo para dos puntos extras en el primer examen parcial.

Vayan al Protein Data Bank.

Busquen la siguientes estructuras:

PDB ID code 116D Escribe la secuencia completo e indica cual es el extremo 5' y cual el 3'

PDB ID code 1D92 Escribe la secuencia de esta doble hélice, existe un error de apareamiento entre las bases ¿cuál es?

PDB ID code 2TRA De la siguiente molécula de tRNA ¿de cuantas hebras se compone? ¿que base tiene en el extremo 5' y cual en el 3'?


Me mandan por mail sus respuestas, tal vez necesiten instalar algun visor de java para verlos, del lado izquierdo donde viene DISPLAY MOLECULE pueden provar con distintos visores para ver la mlécula de manera distinta.

Que se diviertan en sus vacaciones.


Paco