martes, diciembre 09, 2008

El libro el PDF

Hola les dejo el link del libro que les había prometido. Esta en formato PDF y es bastante ligero. Como ya les había mensionado esta en ingles.

Descarga aqui

Mapas de Rutas Metabolicas

Hola les dejo el link de varias páginas con mapas metabólicos:

Aqui van a ver varios de diferentes rutas específicas, sólo imágenes:

http://www.cs.helsinki.fi/group/sysfys/images/index.html


La siguiente es una lista de páginas donde se encontraran los mapas de manera más detallada, algunos son interactivos:

The Main Metabolic Pathways on Internet:
Este tiene todas las fórmulas y nombres de enzimas:

http://home.wxs.nl/%7Epvsanten/mmp/mmp.html


Biochemical Pathways - Metabolic Pathways
Este mapa esta dado por coordenadas y vasta dar un clikc para acercarse a el y verlo de manera más detallada, pueden desplazarse mediante las flechas a los lados de las imágenes:
http://www.expasy.org/cgi-bin/show_thumbnails.pl



Pathways:
Para ver este de manera detallada den click en la vía que quieran ver y se abrirá la vía. Para ver con detalle la reacción pongan el mouse en donde va la enzima:
http://ull.chemistry.uakron.edu/Pathways/index.html


KEGG PATHWAY Database:
Esta es una enciclopedia donde pueden consultar las rutas en diferentes organismos, además si hacen click sobre algun metabolito les despliega información acerca de éste (igual que la página del "Metaboloma" pero con menos información), así como en que rutas participa, aunque no es tan vistoso como los otros casi todo lo que aparece tiene una liga.
http://www.genome.ad.jp/kegg/metabolism.html


Biocarta All Pathways:

Biocarta es otra enciclopedia donde no sólo encontraran rutas metabólicas, sino de procesos celulares diversos tanto en circunstancias normales como en enfermedades y la pueden consultar tanto para humano, como para ratón.
http://www.biocarta.com/genes/allPathways.asp


International Union of Biochemistry &
Molecular Biology (IUBMB):
Aqui encontrarán un mapa muy grande con todas las rutas, les recomiendo que vean los "Minimaps" y los "Animaps" que estan bastante completos y explican reacción por reacción las vías, son muy detallados.
http://www.iubmb-nicholson.org/

Bueno ya tienen con que entretenerse toda esta semana, no es obligatorio recorrer todos, pero espero alguno les sirva para estudiar e irse familiarizando con los nombres en ingles.

Fundamentos del Metabolismo Celular

Hola les dejo el link del "Human Metabolome Database", una base de datos muy completa que contiene todos los metabolitos del humano. Cabe aclarar que tienen que buscar en ingles, por ejemplo si quieren saber algo acerca de la D-Glucosa, basta que escriban "D-Glucose" y les saldra toda la información del metabolito, como descripción general, peso molecular, donde se encuentra y en que concentraciones, formula, representación, con que enfermedades esta relacionado, que enzimas estan relacionadas (descripción de la enzima, en que gen se codifica, donde esta éste gen, secuencia, etc.), les recomiendo la revisen para que se familiaricen. Durante este bloque y en el último la utilizarmos.

http://www.hmdb.ca/

lunes, diciembre 08, 2008

Tercer bloque

Temario del tercer bloque

Por ahora no he terminado el temario ya que aun no me confirman como van a ser las prácticas, así que les recomiendo que no lo impriman aun, es sólo para que se den una idea de como va a ser y se familiaricen con la manera de bajar archivos.

Bienvenidos

Hola Bienvenidos a este espacio que es para ustedes. Que tanto se utilice o que tan útil nos sea dependerá de la participación de ustedes. Aun no me avisan si abrá 2 prácticas para este bloque, por lo que aun no tenemos un calendario definitivo.

En el transcurso de la semana les dejaré algunas páginas que pueden ser útiles para estudiar.

Que tengan felices vacaciones y nos vemos el próximo año.

Paco